Francesc SERRATOSA I CASANELLES

-

Edició de drogues per a la predicció de l'afinitat d'unió proteïna-fàrmac

La predicció de l'afinitat d'unió proteïna-fàrmac presenta una solució viable per accelerar el descobriment de nous compostos químics. S'han presentat alguns mètodes, que tenen en compte l'estructura del fàrmac i la proteïna. Actualment, aquests mètodes es basen en xarxes neuronals i xarxes neuronals de grafs (Graph Neural Networks). L'objectiu d'aquest treball de fi de grau és analitzar com afecten algunes parts del fàrmac en la seva afinitat d'unió. Utilitzarem una base de dades generada a la URV composta per diversos parells de la proteasa principal del SARS-Cov2 i un fàrmac. Tasques específiques en Python: 1. Implementar un editor en Python per visualitzar i modificar manualment compostos químics. Afegir, modificar o eliminar àtoms i enllaços. 2. Aplicar un mètode per predir l’afinitat d'unió proteïna-fàrmac.

05-MAR-2025

Graph Neural Networks. Edició de grafs

Coneixements de Python